Mol* ViewerでAlphaFold3のcifファイルをドラッグ＆ドロップ表示する方法
この記事では、Mol* Viewer（https://molstar.org/viewer/）を使って、AlphaFold3が出力するcifファイルをドラッグ＆ドロップで表示する方法を解説します。
読了後には、ローカルに保存されたAlphaFold3の予測構造をブラウザ上で即座に可視化し、回転・拡大・着色などの基本操作を行えるようになります。
手順1：Mol* Viewerを開く
以下のURLにアクセスします。
手順2：cifファイルをドラッグ＆ドロップする
Mol* Viewerが表示されたら、ローカルに保存された 0.cif ファイル をブラウザ画面上にドラッグ＆ドロップします。
AlphaFold3が出力する複数のcifファイルについて
AlphaFold3では、1回の予測につき 0〜4の番号が付いた複数のcifファイル が出力されます。
- 0.cif
- 1.cif
- 2.cif
- 3.cif
- 4.cif
これらは同一配列に対する異なる予測結果であり、 番号が小さいものほどモデルの信頼度が高いとされています。 この仕様の公式な説明については、記事末尾の出典 [1] を参照してください。
ドロップ後、自動的に構造が読み込まれ、3D表示が開始されます。
手順3：Mol* Viewer上で構造を操作する
- マウスドラッグ：回転
- ホイール操作：拡大・縮小
- 右クリックドラッグ：平行移動
左側のパネルからは、表示形式（cartoon / surface など）や配色の変更も行えます。
まとめ
Mol* Viewerを使えば、専用ソフトをインストールすることなく、 AlphaFold3の予測構造を即座に可視化できます。 ドラッグ＆ドロップ操作により、構造確認の初動を高速化できます。
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